火影忍者手游新时代中期最强阵容的核心在于合理利用忍者属性、技能搭配及队伍协同。根据当前版本数据分析，主流阵容可分为高爆发输出型、控制消耗型、均衡攻守型三类。高爆发阵容以漩涡鸣人九喇嘛连结为核心，搭配千手柱间或宇智波佐助实现短时间奥义连发；控制消耗型依赖我爱罗的沙牢结界和猿飞日斩的五行增幅；均衡型则结合火主/雷主的团队增益与杜门李的速攻特性。需注意阵容需适配饰品套装（如灵狐、海兽）以强化属性，同时根据PVP或PVE场景调整被动技能选择。
中期阶段资源有限时，平民玩家可优先培养风主或雷主阵容。风主推荐手鞠+鹿丸+勘九郎的组合，利用奥义刷新和分身机制实现持续压制；雷主阵容以雷凯奥义为核心，搭配凯和杜门李形成高连击体系。水主叠毒流派在对抗高血量BOSS时表现突出，但需配合牙和天天的多段攻击触发淬毒效果。土主因当前版本使用率较低，仅建议在特定羁绊组合中作为辅助位登场。忍者获取方面，可通过生存挑战、组织商店集中兑换碎片，避免资源分散。
九喇嘛鸣人需在分身充足时释放奥义以触发成长效果；控制型忍者应优先施放限制技能（如沙牢、定身）创造输出环境。需注意查克拉灼烧等负面状态的回合计算，避免关键回合因生命损失导致战败。实战中建议关闭自动战斗模式，手动控制奥义衔接顺序，尤其面对拥有闪避被动的敌人时，需保留破除闪避的技能（如风主普攻分身）。
输出型忍者首选暴击加成的灵狐套装，防御位建议选择玄龟套装提升生存能力。秘卷方面，禁术·阴愈伤灭适合高爆发阵容维持血量，风遁·风沙阵则能增强控制链的稳定性。对于拥有尾兽化机制的忍者，需特别注意查克拉管理，避免因奥义过度消耗触发负面状态。定期参与丰饶之间和妙木仙境副本可稳定获取强化材料。
版本更新后，三代雷影与秽土斑的加入为中期阵容提供新选择。三代雷影的雷遁铠甲可提升小队抗性，配合雷主形成双重增益；秽土斑的须佐能乎形态兼具范围伤害与护盾效果，但需注意其移动速度惩罚。开发中的刻印系统预计将进一步影响阵容构建逻辑，建议保留部分资源应对后续调整。服务器当前竞技场前100名玩家中，漩涡鸣人九喇嘛连结的出场率达67%，佐助天照占42%，反映版本强势角色的优先级。
忍者收集策略上，应优先完成主线任务获取基础S忍，再通过限时活动补充核心A忍。修行商店的忍者碎片每日必换，组织功勋建议投资于迈特凯等关键角色。需注意部分忍者（如晓组织成员）存在阵营加成，同一小队触发2/4人羁绊可获得额外属性提升。战力达到120万时，建议转向精英副本集中获取装备进阶材料，而非继续扩充忍者池。定期参与冠军赛可测试阵容强度，该模式固定属性值的设定能准确反映搭配合理性。
