疯狂动物园中有超过20种隐藏动物需要玩家通过特定条件触发才能抓捕，这些动物分布在草原、丛林、山脉等不同地图区域。暗黑野牛需要骑乘同一只野牛行进800米才会出现，特洛伊斑马则要求连续换乘七种不同的草原动物。油炸狮的获取条件更为苛刻，必须用同一只狮子连续捕食30个动物。这类隐藏动物往往具有独特外观和稀有属性，是玩家收集的重要目标。
丛林区域的隐藏动物包括恐龙犀牛和鸭嘴河马，前者需要连续换乘七种丛林动物，后者则需骑乘同一只河马跑完1600米。三嘴鸟的出现条件较为特殊，玩家需要在巨嘴鸟暴走上升到最高点时起跳并完成100米安全换乘。山脉地图中的苏-24战斗熊要求骑乘老鹰飞行2000米，蒸汽朋克牦牛则需要用同一只牦牛撞击10个动物。这些隐藏动物的抓捕条件往往与地图特性紧密相关。
极地区域的隐藏动物获取方式更具季节性，仙女企鹅需要连续换乘八种不同动物，机械狐狸则要求骑乘同一只狐狸跑完1500米。澳洲地图的变色骆驼需要换乘八种动物，其中必须包含外来物种。部分隐藏动物如骷髅象和外星长颈鹿只能在BOSS任务中随机获得，这种随机性增加了游戏的可玩性和重复体验价值。同一只动物持续骑乘的距离计算不会因复活而清零。
隐藏动物的抓捕技巧需要结合地图特性和动物习性。使用长颈鹿或大象狂暴后将角色甩上高空可以捕捉机械秃鹰，而银河长颈鹿会在狮子准备捕食长颈鹿时出现。部分隐藏动物如哭吼狮提供两种获取方式，既可以连续换乘五只狮子，也能让单只狮子捕食30个动物。玩家需要注意，某些隐藏动物如雄鸡鳄在清晨出现的概率更高，这种时间因素也需要纳入抓捕策略考量。
成功抓捕隐藏动物不仅能丰富动物园的收藏品种，还能解锁特殊成就。暗黑野牛和纯黑鹿等动物需要保持连续骑乘不换乘，这对玩家的操作技巧提出较高要求。火山猩猩和花样虎等BOSS任务限定动物，则考验玩家对任务系统的熟悉程度。游戏设计者通过这种分层级的隐藏内容设置，有效延长了游戏的生命周期，也为玩家提供了持续探索的动力。
隐藏动物的设计体现了游戏机制与生态模拟的深度结合。从需要撞击特定数量动物的鸭嘴河马，到必须完成长距离骑乘的苏-24战斗熊，每种隐藏条件都在模拟动物在自然环境中的行为特征。这种设计思路既增加了游戏的真实感，也使得每次成功的抓捕都能带来独特的成就感。玩家在反复尝试达成条件的过程中，会逐渐掌握各类动物的行为规律和地图特性。
